化妆品代工厂在发展过程中面临着诸多挑战。一方面，市场竞争日益激烈，同行之间为争夺订单，在价格、服务质量和产品创新等方面展开激烈角逐。为了在竞争中脱颖而出，代工厂需要不断提升自身实力，降低生产成本，提高服务水平，加强研发创新能力。另一方面，原材料价格波动频繁，对代工厂的成本控制带来巨大压力。化妆品原材料如植物提取物、油脂类等受自然因素、市场供需关系等影响，价格时常出现大幅波动，这就要求代工厂建立灵活的成本管理机制，通过与供应商协商、优化采购策略等方式，降低原材料价格波动对生产成本的影响。​

从发展趋势来看，随着消费者对化妆品品质和安全性要求的不断提高，化妆品代工厂将更加注重产品质量和研发创新。代工厂将加大在研发方面的投入，引入先进的技术和设备，开发出更安全、更有效的化妆品产品。例如，利用生物技术开发具有特殊功效的化妆品成分，采用纳米技术提高产品的稳定性和吸收效果。同时，绿色环保和可持续发展也将成为化妆品代工厂的重要发展方向。代工厂将采用环保型包装材料，优化生产工艺，减少生产过程中的能源消耗和废弃物排放，以满足消费者对绿色化妆品的需求，顺应行业发展的潮流。